arXiv · cs.LG 机器学习· Dongkwan Kim, Yiming Gao, Yining Yang, Yang Shen·· 4 小时前精选AI 评分72
PertReason 提出细胞状态条件下的扰动效应机制推理基准与框架
PertReason: A Knowledge-Grounded Benchmark and Framework for Cell-State-Conditioned Mechanistic Reasoning of Perturbation Effects
AI 导读
研究团队提出 PertReason，包含基准 PertReasonQA 与参考模型 PertReasonLM，用于评估和改进细胞状态条件下的扰动效应机制推理。PertReasonQA 整合多种细胞环境下的单细胞遗传与化学扰动数据及知识图谱，并按细胞特异性基础状态动态生成通路，以测试模型在新细胞、未见扰动、跨模态与组合外推等分布偏移下能否给出机制上忠实的解释。
推荐理由
该基准把单细胞扰动数据与知识图谱结合，用于检验模型解释是否机制忠实，并给出参考模型的训练路径。
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